Efrem, Suryanicə Afrim) 306-cı ilinə yaxın Mesapatamiyada yerləşən Nisibədə (bügünki Midyat yaxınlığındakı Nusaybin) doğulmuşdur. Atası Abnil tanrısının kahini idi. O gənc yaşında olanda Xristianlığa qarşı olan marağı üstündə evdən qovuldu. Nisibə yepiskopluğuna sığındı və Yepiskop Yaqub onun tərbiyəsi ilə məşğul oldu.
28 (ya da 18, dəqiq məlum deyil) yaşında vəftizi qəbul etdi və bir müddət Kiçik Asiyadakı Amidada (indiki Diyarbəkir, Türkiyə) yaşadı. Daha sonra isə özü üçün monastr həyatını seçdi. Böyük müqəddəslərdən Vasilinin yanına Kapadokiyadakı Kayseriyə getdi. Fars padşahı II Sapor Mesapatamiyadakı Xristianlara qarşı qətliam həyata keçirdi. Efrem monastrdan çıxaraq Xristianlara maddi kömək etməyə getdi. Deyəsən elə o vaxtlarda "diyakon" ləqəbini də aldı. Çünki ancaq həmin vaxtlarda öz vəzifəsini yerinə yetirməkdə idi.